convert (binaire d'imagick) connait beaucoup de formats et permet les conversions.

binaire du paquet swftools

on peut utiliser gs ou convert…

Avec gs (le %d sert à incrémenter un n° suivant les pages du pdf, ici on sort en png 24bits, à 300dpi)
gs -dBATCH -dNOPAUSE -r300 -sDEVICE=png16m -sOutputFile=resultat%d.png source.pdf

• crop auto avec convert -trim