convert (binaire d'imagick) connait beaucoup de formats et permet les conversions.

binaire du paquet swftools

on peut utiliser gs ou convert…

Avec gs (le %d sert à incrémenter un n° suivant les pages du pdf, ici on sort en png 24bits, à 300dpi)
gs -dBATCH -dNOPAUSE -r300 -sDEVICE=png16m -sOutputFile=resultat%d.png source.pdf

La liste est sur http://www.imagemagick.org/script/command-line-options.php (ajouter #option-voulue à l'url pour aller directement sur la description voulue).

La liste des couleurs utilisables http://www.imagemagick.org/script/color.php

pour décaler une image over.png sur une autre (souvent un fond…) under.png de 25 pixel vers la droite et 50 pixels vers le bas :
composite -geometry +25+50 over.png under.png out.png

Créer un fond (blanc) convert -size 600×820 xc:white fond.png

• crop auto avec convert -trim